故事发生在不同于现实的异世界中。在这个世界中，所有的人类均拥有被称为守护精灵的动物同伴，这些动物是人类灵魂的具象体现。女主角莱拉·贝拉奎亚成长于英国牛津的约旦学院。在她前往伦敦寻找失踪的朋友罗杰的过程中，莱拉发现一系列儿…

接着《黑暗物质》第一季的剧情，在结束那段不知为何而战的”旅程”后，人类发现了宇宙深处隐藏的巨大力量来源，那是一个背叛和神秘的黑暗秘密，于是，新的旅途再一次开始了。